金蝶KIS云通过国家等级保护测评、ISO27001等第三方安全认证，服务器部署在腾讯云、AWS亚马逊等安全可靠的云平台，采用防火墙、入侵检测、传输加密、数据备份等安全措施防恶意攻击和防数据泄露。账套数据的所有权归客户所有，数据自主可控，可备份、可下载、可迁移。
