金蝶KIS标准版:1、采用access小型桌面数据库

2、单机使用，通过局域网进行数据共享，其他非软件使用用户可以查询到。

3、账套管理混乱，能随便存放账套文件，无集中管理
金蝶KIS专业版：1、采用MS SQL大型数据库，稳定、安全、快捷；

2、数据存放在服务器数据库里面，公司非软件使用人员不能查询到

3、通过设置服务器能统一整合数据，方便企业管理，不再分散到各个计算机上
三、账套设置
金蝶KIS标准版：1、一个年度一套帐，年结后需转换新帐套，无法进行跨年度查询数据；

2、多帐套管理，帐套间无联系
金蝶KIS专业版：1、年结后无需转换新帐套，多年度一套帐，可实现跨年度查询数据；

2、 多帐套管理，帐套间可实现数据提取；

3、可定时自动备份数据，防止财务数据丢失。

4、帐套用久开设新帐套可系统自动结转新帐套,无需重新开帐初始货；

5、通过权限对帐套管理，增加安全性。
四、基础资料设置
金蝶KIS标准版：1、 级次按开帐时的设置后不得更改，例如3-2-2-2-2；

2、核算项目只能设置3个，不能进行多项目核算
金蝶KIS专业版：1、 灵活设置科目，通过小数点随时增加修改科目级次，可配合核算项目使用；

2、自定义核算项目，可对核算项目进行分类管理，每小类项目可达9999个。